Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms