Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ndufs3Q9DCT2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ndufs3Q9DCT2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms