Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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