Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mlst8Q9DCJ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms