Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop7Q9DCH2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop7Q9DCH2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms