Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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