Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9DA42 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9DA42 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9DA42 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9DA42 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms