Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms