Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl3Q9D8K3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms