Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs6Q9D6W8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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