Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Ptp4a3Q9D658 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ptp4a3Q9D658 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms