Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc83Q9D4V3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms