Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy3Q9D394 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms