Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp35Q9D384 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp35Q9D384 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp35Q9D384 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp35Q9D384 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp35Q9D384 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms