Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ankrd39Q9D2X0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms