Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms