Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mis12Q9CY25 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms