Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Xrcc3Q9CXE6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms