Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms