Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn1Q9CWM4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn1Q9CWM4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn1Q9CWM4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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