Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CactinQ9CS00 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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