Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms