Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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