Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Chmp3Q9CQ10 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Chmp3Q9CQ10 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms