Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp26Q99MX1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp26Q99MX1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp26Q99MX1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms