Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tdrd1Q99MV1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms