Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms