Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms