Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RtcbQ99LF4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms