Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms