Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms