Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms