Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms