Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms