Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Stx18Q8VDS8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stx18Q8VDS8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms