Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fam20bQ8VCS3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fam20bQ8VCS3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fam20bQ8VCS3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fam20bQ8VCS3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fam20bQ8VCS3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms