Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rnf183Q8QZS5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms