Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vrk3Q8K3G5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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