Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms