Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cd300eQ8K249 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms