Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim68Q8K243 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim68Q8K243 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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