Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms