Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Wdr47Q8CGF6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms