Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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