Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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