Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrc9Q8CDN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms