Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CntrobQ8CB62 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms