Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm9958Q8C9U4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm9958Q8C9U4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm9958Q8C9U4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms