Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtp1Q8C8C1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp1Q8C8C1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rtp1Q8C8C1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rtp1Q8C8C1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rtp1Q8C8C1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rtp1Q8C8C1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp1Q8C8C1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rtp1Q8C8C1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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