Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrtm1Q8BXQ3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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